如果读者中有加入生信技能树转录组学习的,应该或多或少见过小零这个名字...
记得刚加群时,里面一直有个人比较活跃,原来是以前有过一定联系的徐洲更师兄,后面他还简单介绍了他现在在做什么,听了之后我非常惊讶他的转变...不过这缓解了我在陌生环境的恐惧,毕竟有个师兄在这里面,还知道很多东西...恰逢群主健明团长在找一位转录组的志愿者帮忙整理转录组群的记录,那时我立马就去申请,苦于没有改好备注,还被团长说了一番。不过好在自己的坚持下,终于争取到了这个宝贵的学习机会。那时我告诉群主,我要向徐洲更师兄学习,不想错过任何可以提升自己的机会,所以我要抓住这个机会。从那天起,一扇通往新世界的大门打开了。虽然现在还在往大门走的旅途中,不过我会继续走下去。
紧接着的是转录组的入门学习,作为一个零基础的小白,看见那些任务说明,一脸的茫然。那时的收获就是,那些看了很多遍的教程,现在不看也可以做了,因为重复了很多次。当时还有很多不会很多不理解,比如每次借鉴别人的命令时,我都不知道那些代码是干嘛的,于是决定争取开学之前完成Linux爱好者发的Linux学习命令目录学习。全部学完之后,终于解决了自己在转录组入门学习时的大部分困惑,不过我必须得说明即使是那些印象深刻的命令我仍不够熟悉,毕竟没有经常使用。教科书式的学习,那个不叫掌握,只能说叫了解是怎么回事。目前有R语言还不懂,等学习进度到那里了,好好学习吧。在汇总转录组学习记录时,我看到很多朋友的进步,看见他们解决了问题,我也非常高兴。可能有些朋友在学习过程中仍然有很多问题没有解决,不过我相信坚持不懈的人后面一定会想各种方法去解决的。
另外我认识到了随手做笔记的重要性,之前都是直接在本子上手写,但是要使用笔记的内容时又得重新去输入一遍,费时费力,所以这时网络在线笔记就很有必要了。在这里感谢青山屋主带来的为知笔记,我在完成任务时,为知笔记帮了很多忙。当然有人用简书,有人用博客,虽然方式不同,目的大致是一样的。关于Markdown方面,我在论坛发文章积累了一定经验,踩过很多坑,不过编辑得多了,进步还是很明显的。不得不说会写md文件,可以让自己写的东西有条理有逻辑,层次分明,阅读效果非常好。
人际交往方面,短短的两三个月里,我认识了很多朋友。他们来自全国各地,甚至是海外。其中有本科生,有研究生,有工程师,有老师,有老板...有些朋友是需要你主动去寻找的,如果你想快速学习一个领域的东西,那你就主动添加一些非常积极的朋友吧,无论他是小白还是大神。小白类朋友会在朋友圈内分享一些很基础的知识,大神类朋友会在朋友圈分享一些比较前沿的知识,当然他们也会分享自己的生活,在这里很感谢这些朋友,让我快速成长。这里可以总结为:你有什么样的好友,你就有什么样的朋友圈。
下面是来自”有各种不同,但都在学习生信“的朋友们的心得、建议或是经历,送给正在学习生信的你:
明天又有一大波宣讲会来袭。上个月跑了一整个月,海投简历。由于天大是一个工科学校,来的企业都是偏招IT的。没怎么有生物的。所以,就乱投,百度投了,腾讯笔试挂了(意料之中,我投的是算法,赴死之心去的吧)。然后华为,面试笔试完没有然后了。。。
别的都是从51job上投的,也拿到了点offer。前几天拒了深圳华大的offer。理由是离家太远。也不知道选择是对是错。反正选择了,就当我们没缘分吧。
找工作的这段我最深的感觉就是一切认真对待,包括最初的做简历,不要说自己投技术就随便大白板,有好看的模板还是要用的,毕竟增彩。不同的岗位用不同的建立,相信很多人说过了,一定要有针对性,不要所有的岗位都用一样的简历!!态度要认真!!要自信!!一定要自信!!如果面试的时候有热情就更好了。
遇到生信菜鸟团整整一年了,想当初自己真的一无所知的就看到菜鸟团博客的时候的欣喜,我想如果它是一个人,我会开心的像个孩子一样跑着过去迎接他。由此莫名的崇拜健明大神。
有时间大家一定要多看看博客和论坛。
一开始跟大家一样,一有问题就问,自己不会搜,慢慢的,在大神的引导下学会自己解决问题,所以哦,告诉大家,遇到问题先自己搜,去google,如果搜不到就说明你的关键字不对,其实很多问题都有人遇到过,分享过。大神就是那个授我以渔的人,也许我自己慧根不咋的,但是遇到了贵人。在菜鸟团,你的努力是有人认可的,是可见的,真的很难得遇到如此有耐心的以及高情商的团长。另外,我是一个没有耐心的以及性子很急的人,但是那句话俗套却不是真的是“心急吃不了热豆腐”,学东西踏踏实实来,一步一个脚印。“如果你想学什么,就不能想着什么都学”!还有做事要认真,“我们没耐心一遍把事情做好,却有耐心一遍一遍的重复修改”。这是我对大家说的话,也是对自己说的话。第二章已经看了很多遍了,还没改好。大论文的编号已经v13了还不是最终版。但是,我知道自己越来越好了,论文也越来越好了。一切都在越来越好了。我还是热情如火。坚信努力没错!时间花在哪里哪里就会开花。最近越发的发现自己学的东西太少,觉得学海无涯。但是怕什么真理无穷,进一寸有一寸的欢喜。加油!
最后,奉上二个字,“努力”!
哈哈哈哈~说到收获的话,那就是大致了解生信在做什么,流程是什么,资源获取的途径,问题解决的途径吧;另外想感叹想团长这样大神的存在与他们的坚持,意外的收获是我现在很烦programming(因为现在是被动学习,被老板赶鸭子上架),但是我还真的对计算机对programming产生了巨大的好奇与兴趣。
第一,我觉得一定要熟悉基本:linux操作系统的用法,特别是sed和awk这两个。第二,要学会掌握一门编程语言。先把基础知识弄懂,然后一定要注重实际,新手入门可以每天看一个别人写的代码,从中熟悉然后写有自己特色的代码。第三,如果你有从事自己的project或者课题,在做生信分析时候,一定要多读与之相关的文献,了解相关的生物学信息。
在我刚接触生信的时候,我以为生信就是BLAST和NCBI。直到2016年那个夏天接触到一批RNA-Seq数据,让我感受到高通量数据分析的魅力,于是就开始了我自学生信这条路。
那个时候没有人指导,一切都靠自己摸索。那个时候为了学习RNA-Seq书分析,专门找了 RNA Data Analysis 这本书去看,看完了两遍,迷迷糊糊还是不懂。 但是在强大的兴趣驱使下,我并没有放弃,坚持了下来。
于是我看了鸟哥的Linux私房菜, 听了马哥的Linux运维课程, 通过网络爬虫入门Python, 在生物统计学课上补充了统计学和R语言, 期间还了解高通量测序的基本概念,看了 Bioinformatic Data Skill 和 biostar handbook 。在如此多的积累之下,终于有一天我感觉自己迈过了生信初学者的门槛,不再像以前那么迷茫了。为了让自己的知识能够沉淀下来,于是我跟着转录组继续从RNA-Seq数据分析开始,传到这里便于自己不断修改。
学习的过程中一定要练习,练习时一定要结合实际数据,勤记笔记。
心得没啥心得,就是一步步按照最基本的流程下来。
主要还是要学会自己解决报错;理解代码意图;等学会了其实一个功能的实现会有多种方法,所以学的第一步模仿出结果,第二步尝试理解和变换;不用追求变换成很简单主要是思维开放,后期针对问题有用;多实践,多搜索,多吸收,多产出;还有就是尝试教别人,会让你理解升华。
其实作为一个农学背景的本科生感觉学习生信还是挺有难度的,第一个就是自己生物学方面的基础还不扎实,最近学了遗传和生理才稍稍感觉踏进生物学的门,第二个就是生信许多计算机方面知识还是很难理解的,刚刚接触Linux的时候,万物皆是文件的思想让人很是崩溃。接触生信一年,陆陆续续的学学做做,好几次都想放弃,毕竟自己的课程任务还有其他校园活动的工作量还是挺大,但是随着所学课程的深入,越来越发现生信的重要性,所以还是想坚持下来,以此为志。同时也希望和我一样的小白抓住现在互联网上丰富的资源,多和大神接触探讨问题,共同进步。
课题有时候不是自己决定的,生信之所以并不是实验的附庸就因为它可以在经过假设驱动在海量的数据里找到自己要的,所以生物信息不仅是计算机技术扎实,更需要多多转换生物学思维,以项目为导向去学习自己需要的东西。检验方法就是你能够笃定地说出你用的数据可靠,结论可靠。这也是我目前向老师努力学习的。计算机技术扎实,能倒腾好的人多,但是真正的计算生物学家却少。勤思考问题和背景,关注科研进展,不要只关注技术。(・ิϖ・ิ)っ
希望以后还能和大家一起学习,一起交流,最后祝大家学习顺利,成为一个优秀的生信人。
http://www.williamlong.info/archives/4319.html(Markdown推荐)
2.http://www.jianshu.com/p/1e402922ee32/(Markdown入门指南)
3.http://doc.zengrong.net/smart-questions/cn.html(提问的智慧)
4.http://mp.weixin.qq.com/s/n9l-edcmbuFYTK6Mw-iSxw(如何养成优秀程序员)
5.https://mp.weixin.qq.com/s/Ol63D6l-QMBL39Hs1o7u7Q(GitHub入门指南)
6.https://mp.weixin.qq.com/s/4jc3tM-2b4YGkl1m9LqhQQ(宏基因组-微生物组知识)
7.http://mp.weixin.qq.com/s/VguRtaGpEcaNzmZEi48gLg(学习生信的系列教程)
8.http://mp.weixin.qq.com/s/rcG6fmJVjRwI9mTanC-wDg(biobabble文章目录)
9.http://mp.weixin.qq.com/s/oo73T4Ym0M6pjVM9mQoT_w(生信媛文章目录)
10.http://mp.weixin.qq.com/s/7DIi_cHd-pitjAz5yXmTaA(生信菜鸟团-专题学习目录)
小零是我在大四时候认识的,我已经记不起为什么会在QQ上加他好友了,但是应该是让他帮我翻译了一部分文献。然后我就很少上QQ了,就像大部分沉睡在好友列表里的人,我也不记得我的好友里有他。不过也算是缘分吧,最后在转录组入门中还能碰到他。
当然他也非常优秀,可以非常踏实把事情做好。当他问我如何学习Linux的时候,我让他一天学习一个Linux命令,并推荐了一篇文章,于是他利用一个暑假的时间把常见60多个Linux命令都学习了一遍。
我建议他把学习信息和笔记都记录下来,他也做到了,于是就有了这一篇心得体会。
我受到李笑来老师文章的鼓励,于是坚持记录自己的笔记,同时也去鼓励真心想入门生信的人也把自己的经历写下来,所以这应该会是一个系列吧。